بدأ برنامج البكالوريوس في الصيدلة في عام ٢٠١٩ كأحد أقسام كلية العلوم الطبية المساندة في حرم الجامعة العربية الأمريكية في جنين. وتلبيةً للاحتياج المستمر في القطاع الصحي لكوادر شابة ومؤهلة قادرة على تقديم خدمات صيدلانية مميزة وبالإضافة الى منهج التطوير ورؤية الجامعة لبرنامج الصيدلة والخريجين تم إنشاء كلية الصيدلة والتي تعتبر الأكثر تميزًا على المستوى المحلي والإقليمي.