في عام 2019، تم إنشاء برنامج بكالوريوس الصيدلة و مدته 5 سنوات استجابة للزيادة المستمرة في الطلب على مقدمي الرعاية الصحية الأولية ولإشباع الحاجة إلى صيادلة مؤهلين تأهيلاً عالياً ونشطين كجزء لا يتجزأ من نظام الرعاية الصحية وصناعة الأدوية. بدأ برنامج الصيدلة في البداية كقسم في كلية العلوم الطبية المساندة في الحرم الجامعي الرئيسي للجامعة العربية الأمريكية في جنين. و لاجل انجاح البرنامج ووفقًا لرؤية الجامعة للبرنامج لكي يصبح مساهمًا رائدًا على الصعيدين الوطني والدولي في جميع جوانب العلوم الصيدلانية، تم إنشاء كلية الصيدلة وإيوائها في مبنى متميز من خمسة طوابق حديثة في خريف 2021/2022 العام الدراسي.

تهدف كلية الصيدلة في الجامعة العربية الأمريكية إلى أن تكون رائدة في تبني منهجيات التدريس الحديثة ووضع استراتيجيات جديدة لخلق تجربة تعليمية فريدة تثري معارف الطلاب وخبراتهم في جميع جوانب الصيدلة والعلوم الصيدلانية. بالإضافة إلى أعضاء هيئة التدريس على مستوى عالمي والتسهيلات الراقية التي تقدمها الكلية لدعم رحلة تعلم الطلاب.